Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 EGD1YPL037C 474 nt1.36□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 YPR153WYPR153W 423 nt1.36□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 YAP3YHL009C 993 nt1.35□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 RPS18BYML026C 441 nt1.35□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 CTK3YML112W 891 nt1.35□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 RPL33BYOR234C 324 nt1.35□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 YPR039WYPR039W 336 nt1.35□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 NUP120YKL057C 3114 nt1.35□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 RTT102YGR275W 474 nt1.34□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.34□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.34□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 FCF2YLR051C 654 nt1.34□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 YBL073WYBL073W 312 nt1.34□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt1.34□□□□□ -2.19
SHQ1P40486 MLH3YPL164C 2148 nt1.34□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 OSH6YKR003W 1347 nt1.34□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 CDC24YAL041W 2565 nt1.34□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 MAK10YEL053C 2202 nt1.34□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 ABM1YJR108W 372 nt1.33□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YOR248WYOR248W 303 nt1.33□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 EST2YLR318W 2655 nt1.33□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 MSN5YDR335W 3675 nt1.32□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.32□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 QCR7YDR529C 384 nt1.32□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 PBI2YNL015W 228 nt1.32□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 SPO75YLL005C 2607 nt1.32□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 RSM22YKL155C 1887 nt1.31□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YGR265WYGR265W 411 nt1.31□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 ALK1YGL021W 2283 nt1.31□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 PBY1YBR094W 2262 nt1.31□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 KAP122YGL016W 3246 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 RVS161YCR009C 798 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YDL152WYDL152W 366 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 MXR1YER042W 555 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 STF2YGR008C 255 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 HHT1YBR010W 411 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 TSC3YBR058C-A 243 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YCL046WYCL046W 324 nt1.3□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 CDC36YDL165W 576 nt1.29□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 BIG1YHR101C 1008 nt1.29□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 RPL16AYIL133C 600 nt1.29□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YPR099CYPR099C 357 nt1.29□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 IRR1YIL026C 3453 nt1.28□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YGR025WYGR025W 303 nt1.28□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.28□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YJL022WYJL022W 309 nt1.28□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 VPS55YJR044C 423 nt1.28□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 YLR269CYLR269C 351 nt1.28□□□□□ -2.2
SHQ1P40486 MSH5YDL154W 2706 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 PAN3YKL025C 2040 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YGR290WYGR290W 444 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 RPF1YHR088W 888 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 COF1YLL050C 432 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 PAU18YLL064C 363 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 HUG1YML058W-A 207 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 PAU6YNR076W 363 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YOL159CYOL159C 516 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 SEC5YDR166C 2916 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 HDA3YPR179C 1968 nt1.27□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.26□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.26□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YNL114CYNL114C 372 nt1.26□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 snR13snR13 124 nt1.26□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 ZRG17YNR039C 1818 nt1.26□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 SWI5YDR146C 2130 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 RAD9YDR217C 3930 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 SIP4YJL089W 2490 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YCR001WYCR001W 315 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 MTC7YEL033W 420 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 HUR1YGL168W 333 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 EMC5YIL027C 426 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 RRT15YLR162W-A 189 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YBR032WYBR032W 303 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 TRM732YMR259C 4263 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 MVP1YMR004W 1536 nt1.25□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 SMC4YLR086W 4257 nt1.24□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YNL122CYNL122C 348 nt1.24□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YOR376WYOR376W 369 nt1.24□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 AZF1YOR113W 2745 nt1.24□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 TOF2YKR010C 2316 nt1.24□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 ZIP1YDR285W 2628 nt1.23□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt1.23□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YER084W-AYER084W-A 513 nt1.23□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.23□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YML108WYML108W 318 nt1.23□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 LOA1YPR139C 903 nt1.23□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 TTI1YKL033W 3117 nt1.23□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 UFD2YDL190C 2886 nt1.22□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 DGR2YKL121W 2559 nt1.22□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YDR509WYDR509W 348 nt1.22□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YHR130CYHR130C 336 nt1.22□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 TMA22YJR014W 597 nt1.22□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YJR029WYJR029W 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.22□□□□□ -2.21
SHQ1P40486 APL2YKL135C 2181 nt1.21□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 YHR125WYHR125W 306 nt1.21□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 NBL1YHR199C-A 222 nt1.21□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 MUK1YPL070W 1839 nt1.21□□□□□ -2.22
SHQ1P40486 RAD50YNL250W 3939 nt1.21□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.9 ms