Protein–RNA interactions for Protein: P38796

PPE1, Protein phosphatase methylesterase 1, yeastyeast

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PPE1P38796 RIM20YOR275C 1986 nt2.41□□□□□ -2.02
PPE1P38796 SMC6YLR383W 3345 nt2.4□□□□□ -2.02
PPE1P38796 YFH1YDL120W 525 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 ALG13YGL047W 609 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YGR265WYGR265W 411 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YHL041WYHL041W 450 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YIL102CYIL102C 306 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 RPA34YJL148W 702 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 ALK2YBL009W 2031 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 SWR1YDR334W 4545 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 PDR11YIL013C 4236 nt2.4□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YGR069WYGR069W 336 nt2.39□□□□□ -2.03
PPE1P38796 JLP2YMR132C 627 nt2.39□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YOR333CYOR333C 417 nt2.39□□□□□ -2.03
PPE1P38796 CDC27YBL084C 2277 nt2.39□□□□□ -2.03
PPE1P38796 SCP160YJL080C 3669 nt2.39□□□□□ -2.03
PPE1P38796 DBP6YNR038W 1890 nt2.39□□□□□ -2.03
PPE1P38796 SVL3YPL032C 2478 nt2.39□□□□□ -2.03
PPE1P38796 CRM1YGR218W 3255 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 SSQ1YLR369W 1974 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 TIM9YEL020W-A 264 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YLR053CYLR053C 327 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YLR149CYLR149C 2193 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 HHT1YBR010W 411 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 MGM1YOR211C 2646 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 RIC1YLR039C 3171 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 RTT107YHR154W 3213 nt2.38□□□□□ -2.03
PPE1P38796 SCD5YOR329C 2619 nt2.37□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YDL211CYDL211C 1119 nt2.37□□□□□ -2.03
PPE1P38796 LYS9YNR050C 1341 nt2.37□□□□□ -2.03
PPE1P38796 NUP170YBL079W 4509 nt2.37□□□□□ -2.03
PPE1P38796 PSD2YGR170W 3417 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 SEF1YBL066C 3447 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 MLH1YMR167W 2310 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 MRP10YDL045W-A 288 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YDL062WYDL062W 426 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YBR224WYBR224W 516 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 RAV1YJR033C 4074 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 CLN3YAL040C 1743 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 PEX8YGR077C 1770 nt2.36□□□□□ -2.03
PPE1P38796 EDS1YBR033W 2760 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 NPC2YDL046W 522 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 VTC1YER072W 390 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 NUT2YPR168W 474 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 DAD3YBR233W-A 285 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 MNE1YOR350C 1992 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 PEP3YLR148W 2757 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YBR184WYBR184W 1572 nt2.35□□□□□ -2.03
PPE1P38796 SMY1YKL079W 1971 nt2.34□□□□□ -2.03
PPE1P38796 VPS13YLL040C 9435 nt2.34□□□□□ -2.03
PPE1P38796 snR80snR80 171 nt2.34□□□□□ -2.03
PPE1P38796 HYP2YEL034W 474 nt2.34□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YHL042WYHL042W 453 nt2.34□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YIL032CYIL032C 357 nt2.34□□□□□ -2.03
PPE1P38796 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.34□□□□□ -2.03
PPE1P38796 APL5YPL195W 2799 nt2.34□□□□□ -2.04
PPE1P38796 RAD61YDR014W 1944 nt2.34□□□□□ -2.04
PPE1P38796 PHO2YDL106C 1680 nt2.34□□□□□ -2.04
PPE1P38796 ATG11YPR049C 3537 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YAL059C-AYAL059C-A 423 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YML007C-AYML007C-A 111 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 COG8YML071C 1824 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 IRR1YIL026C 3453 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YEF3YLR249W 3135 nt2.33□□□□□ -2.04
PPE1P38796 HDA3YPR179C 1968 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 SPF1YEL031W 3648 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 MCD1YDL003W 1701 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 PCC1YKR095W-A 267 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YPR063CYPR063C 423 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 SCH9YHR205W 2475 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 ARP7YPR034W 1434 nt2.32□□□□□ -2.04
PPE1P38796 TRA1YHR099W 11235 nt2.31□□□□□ -2.04
PPE1P38796 MGA2YIR033W 3342 nt2.31□□□□□ -2.04
PPE1P38796 BLI1YKL061W 342 nt2.31□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YNL337WYNL337W 255 nt2.31□□□□□ -2.04
PPE1P38796 snR49snR49 165 nt2.31□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YCR018C-AYCR018C-A 255 nt2.3□□□□□ -2.04
PPE1P38796 ANS1YHR126C 480 nt2.3□□□□□ -2.04
PPE1P38796 UPS1YLR193C 528 nt2.3□□□□□ -2.04
PPE1P38796 NOP53YPL146C 1368 nt2.3□□□□□ -2.04
PPE1P38796 VPH1YOR270C 2523 nt2.3□□□□□ -2.04
PPE1P38796 VPS34YLR240W 2628 nt2.3□□□□□ -2.04
PPE1P38796 STH1YIL126W 4080 nt2.29□□□□□ -2.04
PPE1P38796 EFR3YMR212C 2349 nt2.29□□□□□ -2.04
PPE1P38796 YLR146W-AYLR146W-A 189 nt2.29□□□□□ -2.04
PPE1P38796 TFC3YAL001C 3483 nt2.29□□□□□ -2.04
PPE1P38796 GIP3YPL137C 3831 nt2.29□□□□□ -2.04
PPE1P38796 INO80YGL150C 4470 nt2.29□□□□□ -2.04
PPE1P38796 SAP190YKR028W 3102 nt2.28□□□□□ -2.04
PPE1P38796 SNF5YBR289W 2718 nt2.28□□□□□ -2.04
PPE1P38796 SET2YJL168C 2202 nt2.28□□□□□ -2.04
PPE1P38796 VMR1YHL035C 4779 nt2.28□□□□□ -2.04
PPE1P38796 CDC36YDL165W 576 nt2.28□□□□□ -2.04
PPE1P38796 SDH2YLL041C 801 nt2.28□□□□□ -2.04
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