Protein–RNA interactions for Protein: P37840

SNCA, Alpha-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAP37840 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SNCAP37840 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNCAP37840 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNCAP37840 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNCAP37840 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNCAP37840 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SNCAP37840 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SNCAP37840 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SNCAP37840 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SNCAP37840 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms