Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OTX2P32243 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
OTX2P32243 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
OTX2P32243 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms