Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXA13P31271 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXA13P31271 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms