Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CDC27P30260 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CDC27P30260 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CDC27P30260 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDC27P30260 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CDC27P30260 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CDC27P30260 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CDC27P30260 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CDC27P30260 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms