Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ARID4AP29374 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ARID4AP29374 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms