Protein–RNA interactions for Protein: P28329

CHAT, Choline O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHATP28329 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CHATP28329 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CHATP28329 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CHATP28329 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CHATP28329 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CHATP28329 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms