Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-DMAP28067 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-DMAP28067 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms