Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTAFRP25105 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PTAFRP25105 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms