Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
VAMP1P23763 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
VAMP1P23763 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms