Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCP2P22307 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCP2P22307 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCP2P22307 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCP2P22307 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms