Protein–RNA interactions for Protein: P21399

ACO1, Cytoplasmic aconitate hydratase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACO1P21399 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ACO1P21399 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ACO1P21399 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ACO1P21399 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ACO1P21399 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ACO1P21399 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ACO1P21399 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACO1P21399 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACO1P21399 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ACO1P21399 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms