Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LMNB1P20700 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LMNB1P20700 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms