Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CD33P20138 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CD33P20138 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CD33P20138 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD33P20138 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CD33P20138 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CD33P20138 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CD33P20138 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms