Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NCLP19338 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NCLP19338 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NCLP19338 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCLP19338 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCLP19338 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCLP19338 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCLP19338 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NCLP19338 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NCLP19338 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NCLP19338 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms