Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
ATF3P18847 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
ATF3P18847 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
ATF3P18847 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ATF3P18847 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms