Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EGR1P18146 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EGR1P18146 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EGR1P18146 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms