Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LYL1P12980 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
LYL1P12980 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
LYL1P12980 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
LYL1P12980 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LYL1P12980 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LYL1P12980 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms