Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLI3P10071 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLI3P10071 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLI3P10071 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLI3P10071 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GLI3P10071 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GLI3P10071 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GLI3P10071 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GLI3P10071 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
GLI3P10071 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GLI3P10071 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GLI3P10071 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GLI3P10071 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GLI3P10071 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms