Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TMIGD3P0DMS9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TMIGD3P0DMS9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms