Protein–RNA interactions for Protein: P0DJJ0

SRGAP2C, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRGAP2CP0DJJ0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms