Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
RGPD1P0DJD0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD1P0DJD0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD1P0DJD0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms