Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
USP17L7P0C7H9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
USP17L7P0C7H9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms