Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXB7P09629 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms