Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MMP10P09238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MMP10P09238 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MMP10P09238 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MMP10P09238 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MMP10P09238 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MMP10P09238 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MMP10P09238 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms