Protein–RNA interactions for Protein: P05067

APP, Amyloid-beta A4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APPP05067 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPP05067 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
APPP05067 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
APPP05067 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
APPP05067 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
APPP05067 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
APPP05067 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
APPP05067 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
APPP05067 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
APPP05067 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
APPP05067 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms