Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	APQ13	YJL075C	417 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YNL114C	YNL114C	372 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YPR153W	YPR153W	423 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	DCP2	YNL118C	2913 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	MSC6	YOR354C	2079 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	DAS1	YJL149W	1992 nt		0.87	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	MSS11	YMR164C	2277 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	SHE9	YDR393W	1371 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	GUP1	YGL084C	1683 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YEL050W-A	YEL050W-A	192 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	RPF1	YHR088W	888 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	SPC1	YJR010C-A	285 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	STE18	YJR086W	333 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	CDC24	YAL041W	2565 nt		0.86	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	SNF5	YBR289W	2718 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	SRP14	YDL092W	441 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	QCR7	YDR529C	384 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YER121W	YER121W	345 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YER135C	YER135C	393 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	LCL2	YLR104W	396 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	CGI121	YML036W	546 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YNL303W	YNL303W	348 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	ZRG8	YER033C	3231 nt		0.85	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	SIP4	YJL089W	2490 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	RPL9A	YGL147C	576 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YGR290W	YGR290W	444 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YAP3	YHL009C	993 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	CDC33	YOL139C	642 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YBR071W	YBR071W	636 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	YPR039W	YPR039W	336 nt		0.84	□□□□□ -2.27
VAR1	P02381	BEM2	YER155C	6504 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YGR250C	YGR250C	2346 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	MET32	YDR253C	576 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YER088C-A	YER088C-A	324 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	HUR1	YGL168W	333 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	tV(UAC)B	tV(UAC)B	74 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	tV(UAC)D	tV(UAC)D	74 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YJL022W	YJL022W	309 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	PAU18	YLL064C	363 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YLR269C	YLR269C	351 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	PAU6	YNR076W	363 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	SLM6	YBR266C	453 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	SEF1	YBL066C	3447 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	SMY1	YKL079W	1971 nt		0.83	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	AZF1	YOR113W	2745 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YEL057C	YEL057C	702 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YER084W-A	YER084W-A	513 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YGR025W	YGR025W	303 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	ANS1	YHR126C	480 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	FYV7	YLR068W	456 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	PGA1	YNL158W	597 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YOR248W	YOR248W	303 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	RLM1	YPL089C	2031 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YBR184W	YBR184W	1572 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YPR117W	YPR117W	7470 nt		0.82	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	KAP122	YGL016W	3246 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	ALK1	YGL021W	2283 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	SCC2	YDR180W	4482 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	SPR3	YGR059W	1539 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YCR102W-A	YCR102W-A	198 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YEL030C-A	YEL030C-A	315 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	IES5	YER092W	378 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	RPS18B	YML026C	441 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YPR063C	YPR063C	423 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YGR130C	YGR130C	2451 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	OSH6	YKR003W	1347 nt		0.81	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YDR169C-A	YDR169C-A	150 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YER023C-A	YER023C-A	213 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	EAF6	YJR082C	342 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YML003W	YML003W	873 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	PBI2	YNL015W	228 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	snR13	snR13	124 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	TSC3	YBR058C-A	243 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YPR099C	YPR099C	357 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	PAN3	YKL025C	2040 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	UFD2	YDL190C	2886 nt		0.8	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	SMC1	YFL008W	3678 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YDR509W	YDR509W	348 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YHR028W-A	YHR028W-A	321 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YKL183C-A	YKL183C-A	213 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	AIM29	YKR074W	468 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	COF1	YLL050C	432 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YBR032W	YBR032W	303 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	snR189	snR189	189 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	IFH1	YLR223C	3258 nt		0.79	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YDL152W	YDL152W	366 nt		0.78	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YDR003W-A	YDR003W-A	123 nt		0.78	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	SWI5	YDR146C	2130 nt		0.78	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	YOR192C-C	YOR192C-C	237 nt		0.78	□□□□□ -2.28
VAR1	P02381	TTI1	YKL033W	3117 nt		0.78	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YCR001W	YCR001W	315 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YGR045C	YGR045C	363 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	ABM1	YJR108W	372 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	TOM22	YNL131W	459 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	snR14	snR14	160 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	YOR192C-A	YOR192C-A	1317 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	MVP1	YMR004W	1536 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	MUK1	YPL070W	1839 nt		0.77	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	RAD50	YNL250W	3939 nt		0.76	□□□□□ -2.29
VAR1	P02381	VPS54	YDR027C	2670 nt		0.76	□□□□□ -2.29

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