Protein–RNA interactions for Protein: P01100

FOS, Proto-oncogene c-Fos, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSP01100 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FOSP01100 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FOSP01100 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FOSP01100 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOSP01100 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FOSP01100 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FOSP01100 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FOSP01100 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms