Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MBD4O95243 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MBD4O95243 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MBD4O95243 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD4O95243 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD4O95243 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD4O95243 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD4O95243 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD4O95243 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MBD4O95243 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MBD4O95243 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MBD4O95243 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms