Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ATG12O94817 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ATG12O94817 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms