Protein–RNA interactions for Protein: O94813

SLIT2, Slit homolog 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT2O94813 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
SLIT2O94813 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLIT2O94813 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLIT2O94813 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms