Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NEBLO76041 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NEBLO76041 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NEBLO76041 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NEBLO76041 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NEBLO76041 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEBLO76041 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEBLO76041 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEBLO76041 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEBLO76041 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NEBLO76041 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms