Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
E2F6O75461 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
E2F6O75461 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
E2F6O75461 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
E2F6O75461 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
E2F6O75461 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms