Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRPF40AO75400 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF40AO75400 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms