Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
NIPSNAP2O75323 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms