Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RAB11FIP3O75154 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RAB11FIP3O75154 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms