Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
LRRTM2O43300 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
LRRTM2O43300 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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