Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ARPC1BO15143 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms