Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPRTO14522 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPRTO14522 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
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