Protein–RNA interactions for Protein: O00443

PIK3C2A, Phosphatidylinositol 4-phosphate 3-kinase C2 domain-containing subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C2AO00443 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PIK3C2AO00443 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PIK3C2AO00443 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms