Protein–RNA interactions for Protein: O00399

DCTN6, Dynactin subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN6O00399 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
DCTN6O00399 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms