Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HIP1O00291 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIP1O00291 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIP1O00291 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HIP1O00291 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIP1O00291 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIP1O00291 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIP1O00291 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIP1O00291 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HIP1O00291 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HIP1O00291 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HIP1O00291 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms