Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
NFKBIEO00221 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NFKBIEO00221 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms