Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
NEDD8-MDP1E9PL57 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NEDD8-MDP1E9PL57 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms