Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ03

CYSRT1, Cysteine-rich tail protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYSRT1A8MQ03 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CYSRT1A8MQ03 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CYSRT1A8MQ03 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms