Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP27XA6NNY8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
USP27XA6NNY8 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
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