Protein–RNA interactions for Protein: A6NKG5

RTL1, Retrotransposon-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL1A6NKG5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
RTL1A6NKG5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RTL1A6NKG5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms