Protein–RNA interactions for Protein: A6NI87

CBY3, Protein chibby homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBY3A6NI87 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CBY3A6NI87 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms