Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
STRCP1A6NGW2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRCP1A6NGW2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms